Los días 1 y 2 los paga el empleador. Del día 3 al 180 paga la EPS. Del día 181 al 540 paga el fondo de pensiones, siempre que la EPS haya emitido el concepto de rehabilitación. Desde el día 541 vuelve a pagar la EPS.

En enfermedad general se paga el 66,67 % del IBC hasta el día 90 y el 50 % desde el día 91. Ningún día puede pagarse por debajo del salario mínimo diario. En accidente o enfermedad laboral, y en licencias de maternidad y paternidad, se paga el 100 % del IBC.

Cuando tiene el mismo diagnóstico o uno relacionado y empieza máximo 30 días después de que terminó la anterior. Los días se suman y la persona sigue avanzando en los tramos de pago.

Antes del día 120 la EPS debe emitir el concepto de rehabilitación y enviarlo al fondo de pensiones antes del día 150. Con ese concepto, el fondo paga desde el día 181 hasta el 540.

La licencia de maternidad es de 18 semanas (126 días), con 2 semanas más en parto múltiple y días adicionales en parto prematuro. La licencia de paternidad es de 2 semanas (14 días). Ambas las paga la EPS al 100 % del IBC.